MacMolPlt

Originalartikel wurde veröffentlicht von Brett Bode

MacMolPlt ist:

  • Ein modernes Grafikprogramm für Malen von 3-D molekularen Strukturen und Normalregimen (Vibrationen). Modern heißt hier:
    • Mausgelenktes Interface für rechtzeitliche Rotation und Übersetzung.
    • Möglichkeit aus/in anderen Grafikprogrammen auszuschneiden und einzusetzen (z.B. ChemDraw).
    • Resultate sind einfach auszudrucken auf schwarz-weißen und Farbedrucker (hoehe Druckqualität).
    • Möglichkeit meherere Files gleichzeiting geöffnet zu haben.
  • MacMolPlt liest unterschiedliche Formate inklusive GAMESS. Man kann log in, Informationen oder IRC Files eingeben und eigentlich Animationen IRC, DRC, und Optimisationen schaffen. Sie können auch $VEC Gruppe aus beliebigem File importieren (z.B. GAMESS .DAT file). MacMolPlt  unterstützt auch xMol XYZ files, Format MolDen und Sprache Chemical Markup (CML). Dazu is Unterstützung von Files  PDB und MDL MolFile eingeschlossen.
  • Molekulargruppensymmetrie ist unterstützt.
  • Man kann auch kartesianische Koordinatenstile GAMESS und Gaussian-92 direkt ins Programm einsetzen.
  • Animation und Normalregime.
  • Animation IRC und DRC mit Orbitralen.
  • Einfache energetische Diagrammen  (darunter auch geometrische Parameter).
  • Lineales Schaubild einfacher Frequenz oder der Frequenz gegesätzlicher der infraroten oder Ramanstrahlung. 
  • Man kann meherere GAMESS files vereinigen, um eine Ganzanimation zu bilden.
  • Molekeln mit Hilfe von grafischem Instrument für Molekelnbauen bilden und umarbeiten.
    • Schnell eine 3D Struktur einer realen Molekel bilden.
    • Gewählte Atome rotieren, Zusammenhänge und dihedrale Winkel.
    • Gewählte Untergruppen übersetzen und drehen.
  • Molekeln mit Hilfe kartesianischer und innerer Koordinate bilden
  • 2D Abbildung von orbitraler, gemeinsamer Elektronendichte auf einer Umrißkarte  
  • 3D Abbildung von orbitraler, gemeinsamer Elektronendichte
  • Dichteunterschiedekarten
  • Karten von Potential molekulerer Elektrostatik
  • Einfaches GAMESS Instrumenteninput
  • 3D Bilder in Farbe und mit Beleuchtung, Schatten mit Hilfe von OpenGL unter MacOS X.

Anmerkung:

MacMolPlt ist ein kostenloses Programm, aber falls Sie das Programm rennen, bitte schicken Sie  mir einen Brief, über was Ihnen gefallen hat, was nicht (und was nicht zu gefallen ist;-).

Wenn Sie MacMolPlt für eine Publikation verwenden, die Referenz ist:

Bode, B. M. and Gordon, M. S. J. Mol. Graphics Mod., 16, 1998, 133-138.